即使在各地群雄割据，狼烟四起的安土桃山时代，宏伟壮观、各具特色的庭院仍旧问世不断，织田信长在京都二条城建造的高级庭院就是其中一例。时至现代，即明治年代到今天，这一时期建造的庭院为现代庭院，随科学技术的进步出现艺术性和实用性兼顾的新发展。单纯、质朴是日本文化的坚实基础，在这方面最典型的便是庭院。日本庭院与欧美国家的由树木和石块布局，整齐犹如几何图案的庭院不同，日本的庭院则是再现自然一部分的风景式庭院。流水、池塘、叠石、树木、假山等配合在一起使之变幻莫测，显示出自然界原本的风景。它出自于借景的想法，即把远处的山和看得见的景致纳入为庭院景色的一部分。日本传统的庭院就是这样巧妙地把自然景色中的一部分融汇在一起，从庭院建筑的构想来看，日本庭院大致可分为两个流派：自然主义派和宗教色彩派。
自然主义派的庭院要追溯到飞鸟时代。日本式庭院的结晶，要数寝殿式建筑的庭院了，这种寝殿式庭院配以假山、池塘、流水、树木等。还有一种能代表自然中心主义的庭院，那就是江户时代造的大名庭院。那时各国大名在各自的故乡及江户的住宅地建造了大规模的庭院。在环游式的园子里，造出了模仿天下名胜的景致，大量地使用了名贵石块与名贵木材。被称为日本三园的有：水户的偕乐园、金泽的兼六园、冈山的后乐园。